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vendredi 6 mai 2011

Pour les biologistes et biochimistes qui souhaitent se perfectionner à la bioinformatique.


Pour les biologistes et biochimistes qui souhaitent se perfectionner à la bioinformatique.

Public concerné et conditions d’accès

Cette formation s'adresse à des biologistes/biochimistes titulaires d'un diplôme de type Bac+2 dans la biologie/biochimie et qui, à cause des progrès des biotechnologies, sont aujourd'hui quotidiennement confrontés à la Bioinformatique sans l'avoir jamais apprise. 
Les enseignements dispensés leur permettront de gérer au mieux l'évolution actuelle de leur métier.
Les étudiants ayant une formation de type L1/L2 pourront s'inscrire en licence professionnelle de bioinformatique si leur profil est équivalent à celui des traditionnels Bac+2 en biologie/biochimie.
Ils devront avoir reçu l'équivalent d'une formation de base en Biochimie (au moins 60 heures), en biologie cellulaire et moléculaire (au moins 60 heures), et en physiologie (au moins 60 heures).

Finalité du diplôme / certificat

Objectifs pédagogiques

  • Etre initié aux problématiques bioinformatiques liées à l'émergence des nouvelles biotechnologies
  • Connaître les moyens pour utiliser les logiciels existants sur le Web qui permettent déjà de traiter de manière puissante les données biologiques générées par les nouvelles biotechnologies (bases de données, logiciels de traitement de séquence, logiciels statistiques)
  • Maîtriser les bases du développement informatique pour solutionner les problématiques posées par les nouvelles biotechnologies (développement et déploiement d'applications et intégration de logiciels) du type des analyses génomiques ou protéomiques.

Compétences visées

La certification professionnelle atteste des compétences et capacités suivantes :
- appliquer des méthodes d'analyse et de diagnostic des besoins clients (analyse de la valeur, groupes d'usagers') et créer un projet correspondant à cette demande (prédiction de gènes, création d'un logiciel),
- gérer les données de biologie moléculaire et cellulaire à partir des protocoles mis en place (application de la génomique structurale et fonctionnelle),
- participer à la conception de nouveaux outils informatiques destinés à l'analyse in silico (prédiction de gènes, de structures, d'interactions'), à l'analyse de données d'expression (transcriptome, protéome...) et à la modélisation de processus cellulaires et réseaux moléculaires),
- intégrer des sources hétérogènes dans les bases de données (nomenclature, analyse de textes, ontologies...),
- développer des applications spécifiques (installation, paramétrage et diffusion d'applications généralistes),
- diffuser et mettre à jour des banques de données en repérant les redondances et complémentarités des données et en gérant leur cohérence,
- développer des interfaces utilisateurs pour l'aide à l'analyse et à l'extraction des connaissances,
- assurer une veille technique portant sur l'évolution des biotechnologies et des réglementations du secteur (création d'une liste documentaire et de rapports ou de synthèses documentaires sur des sujets scientifiques, application des méthodes de recherche bibliographique, rédaction de documents techniques en anglais et en français, organisation de la diffusion.

Organisation

Nombre de crédits ECTS : 60

Stages, projets, mémoire

Le sujet du projet devra être choisi parmi 3 possibilités (le thème du projet devra être lié au domaine professionnel)de l'étudiant et ce dans 3 grands domaines actuels de la bioinformatique:-Le traitement des séquences-La modélisation moléculaire-L'analyse des données génétique. Le projet tutoré correspondra à 250 heures de travail personnel de l'étudiant, et correspond à 11 ECTS.Les modalités du contrôle seront les suivantes :- Un rapport de 15 pages dactylographié et relié - Une présentation orale de 10 minutes faite individuellement par chaque étudiant avec 5 minutes de questions. Le suivi des stages est assuré par un tuteur local dans l'entreprise. Une convention sera signée entre le CNAM et l'entreprise mentionnant le nom du tuteur de l'entreprise. Un projet de travail sera soumis au départ par le tuteur aux enseignants. L'évaluation : Un questionnaire sera envoyé au tuteur pour avoir son appréciation globale. Un rapport de 10 pages sera fait par chaque étudiant pour valider son stage. Une présentation orale de 10 minutes sera aussi demandée. Une note globale sera attribuée qui sera la moyenne entre la note du tuteur, la note du rapport, la note de la soutenance orale. Les étudiantsformation continue rendront eux aussi un mémoire de 10 pages décrivant leur activité dans leur entreprise. Le stage de 3 mois compte pour 5 ECTS. le projet tuteuré correspond à 150 heures de travail personnel de l'étudiant

Conditions de délivrance du diplôme

Les UE seront notées de manière indépendante des stages et projets tutorés. Pour l'UE d'Anglais un succès au test Bulat de niveau 1 est requis. Pour les autres UE, une note inférieure ou égale à 7/20 sera éliminatoire. L'étudiant aura obtenu son diplôme s'il obtient une moyenne supérieure à 10/20 dans les matières informatiques/bioinformatiques (UE 1 à 7), et une note supérieure à 10/20 pour le stage, le projet tutoré, après les délibérations du Jury.

Code : LP014
  • Sciences et technologies de l'information et de la communication
  • Crédits européens

Responsable national :
  • Jean-François ZAGURY
Mentions officielles
Intitulé officiel : Licence professionnelle biotechnologie, spécialité bioinformation pour les biotechnologies. Diplôme habilité. Enregistré de droit au RNCP Arrêté du 22 août 2007. Habilitation pour 4 ans  Niveau d'entrée : bac+2 Niveau de sortie : Certification de niveau II (Bac + 3 et 4)  Mode d'accès à la certification - Formation continue  - VAE  - Contrat de profesionnalisation  - Unités capitalisables  Inscrit RNCP : inscrit Code NSF : Agroalimentaire - alimentation - cuisine (221) Code ROME : Informaticien/Informaticienne d'étude (32321)
Contacts à Paris
Chaire de Bioinformatique
  • 292 rue St Martin
  • 75003 Paris
  • Accès 17.0.16
  • Tél : 01 40 27 25 81
  • Christiane Morel
  • Contacter par mail
Informations complémentaires
Plus d'informations sur le site de la composante
Signature CNAM


Description de la formation






Bases Informatiques : Systèmes d'exploitation, bases de données, Internet
BNF101
6
CRÉDITS



Initiation à la programmation
BNF102
6
CRÉDITS



Algorithmique et programmation avec Java : notions de base
NFA001
4
CRÉDITS



Algorithmique programmation avec Java : concepts objet
NFA002
6
CRÉDITS



Algorithmique de la bioinformatique
BNF103
6
CRÉDITS



Biostatistique
STA109
6
CRÉDITS



Utilisation et applications de la bioinformatique
BNF104
6
CRÉDITS



Test d'anglais (Bulat niveau 1)
UA2B14
4
CRÉDITS



Projet bioinformatique
BNF105
11
CRÉDITS



Stage de 3 mois
UA3411
5
CRÉDITS